据昆明市滇管局相关负责人介绍，保护区将分为４个区域。核心区包括松华坝、宝象河、柴河、大河４个城市饮用水源水库一级保护区，除科学研究需要外，禁止任何单位个人进入；季节性核心区，滇池湖泊的水域部分，在特定季节内（如禁渔期）按核心区管理；缓冲区包括４个城市饮用水源水库保护区的一级保护区陆域部分中森林生态系统较为完善的区域，只允许从事科研观测活动，不得从事任何基础设施建设或破坏环境的活动；实验区包括４个城市饮用水源水库保护区的一级保护区陆域部分中森林生态系统需要恢复的区域、３６条入滇河道及两岸外延２０米－５０米范围，滇池湖滨带、滇池西岸部分面山，该区域可开展适量的生态旅游活动，但不得建设污染环境、破坏资源或者景观的设施。
昆明市副市长王道兴说，目前，该市已开展滇池高原湿地保护区详细规划的编制工作。