流域总面积达２．９６万平方公里的青海湖流域是维系青藏高原东北部生态安全的重要水系，受人类活动和全球变暖趋势影响，青海湖流域植被退化、水土流失加剧，荒漠化扩展、生物多样性锐减。保护青藏高原上的这片雪域圣湖，对于调节区域内气候条件、阻止西部荒漠化向东蔓延，改善流域内农牧民的生产生活条件具有重大意义。
从２００８年５月起，国家计划在１０年内投资１５．６７亿元开展青海湖流域生态环境保护与综合治理工程，是继三江源生态保护与建设工程之后国家在青海省开展的第二个大型生态环境综合治理项目。
据了解，此次中央新增的５０００万元专项资金将主要用于青海湖流域退化草地综合治理、河道整治、沙漠化土地治理、生态林建设、湿地保护、生态监测等六大类工程。至此，国家总共已下拨这一工程的专项资金３．５亿元。