玉树是这三大河流的发源地，素有“江河之源”、“名山之宗”和“中华水塔”的美誉。地震给这里的生态环境带来巨大潜在威胁。
地震发生后，青海省的环保部门就启动了突发环境事件应急预案和一级响应机制，迅速制定了灾区环境监测预警方案、水污染处置预案、应急监测方案，对灾区饮用水水源地水质、地表水水质、环境空气质量进行了应急监测。
长江流域水资源保护局监测团队在震后也火速赶到了灾区一线，对结古镇1000人以上的12个受灾群众安置点用水水源全部进行了调查检测。目前，灾区水质尚未出现异常。
抗震救灾前线指挥部紧急抽调垃圾转运车辆，设置固定垃圾收集点及时收集，动员组织各方面力量，集中清理生活垃圾并转运到垃圾填埋场。为了普及饮水安全和生态保护知识，青海省环保部门还编制散发了《玉树地震灾区饮用水安全保障技术指南》等宣传手册2.2万册，下发给灾区群众。 (记者龚仕建、王建新)